腦炎的后遺癥多以肌肉癱瘓為主，但是部分患者由于病情嚴(yán)重，神經(jīng)系統(tǒng)受到較大程度的損害，因而表現(xiàn)為智能發(fā)育遲緩，也就是常說的腦癱。
腦炎往往見于兒童，因此發(fā)現(xiàn)兒童出現(xiàn)高熱，要引起足夠的重視，及早進(jìn)行藥物或者物理降溫治療，及時查明發(fā)熱原因，避免神經(jīng)系統(tǒng)損害。
大部分的腦炎后遺癥通過積極治療之后不會越來越嚴(yán)重。為了降低患者將來出現(xiàn)后遺癥的風(fēng)險，這些患者一定要盡早就診，需要及時完善腦脊液的化驗，以對腦炎進(jìn)行定性診斷。
病毒性腦炎的后遺癥比較多，患者會有失語的表現(xiàn)，或是語言表達(dá)能力極度減退，出現(xiàn)語言遲鈍。
吞咽功能和視神經(jīng)也可受病毒性腦膜炎影響，成為在日后留存在患者身上的后遺癥。
病毒性腦膜炎還引起不少患者癱瘓，甚至是造成視神經(jīng)的損傷，引起患者耳聾、癲癇等等很多神經(jīng)系統(tǒng)上的后遺癥。
另外，病毒性腦炎還可能會給患者留下精神狀態(tài)及認(rèn)知功能異常的諸多后遺癥。例如患者的記憶力減退，理解能力、智力下降，使病愈后的患者表情冷漠，眼神呆滯，或是出現(xiàn)相反的異常興奮、易怒的表現(xiàn)。很多人得過腦炎后，都變得喜怒無常，特別喜歡攻擊別人。
多汗、愛流口水也是病毒性腦膜炎導(dǎo)致患者自主神經(jīng)功能失調(diào)所留下的后遺癥。
細(xì)菌性腦膜炎可能會給患者留下的比較嚴(yán)重的后遺癥包括：意識、行為上的障礙，患者的運動功能、視力也會有不同程度的下降，另外不少人還會因細(xì)菌性腦膜炎而引發(fā)癲癇、腦積水。
比較輕的后遺癥則為：輕微的行為問題，學(xué)習(xí)困難。有單側(cè)聽力喪失的現(xiàn)象，患者的肌的張力會有所降低。在視覺方面，患者觀察一個物體常會出現(xiàn)兩個物象的復(fù)視感。
