該學科由伍漢文教授等創(chuàng)建于20世紀50年代。1950年，伍漢文畢業(yè)留校于湘雅醫(yī)院內(nèi)科，被指定開展內(nèi)分泌學的醫(yī)療和教學工作。1958年，湖南醫(yī)學院附屬第二醫(yī)院開院，伍漢文和超楚生轉(zhuǎn)至該院內(nèi)科工作，在內(nèi)科教研室設(shè)立內(nèi)分泌專業(yè)組。1962年，建立內(nèi)分泌實驗室，逐步開展了尿17-羥、血清蛋白結(jié)合碘、尿兒茶酚胺等檢測項目，并據(jù)此確診一例甲狀腺機能亢進自發(fā)粘液性水腫，在國內(nèi)首次提出了甲狀腺自身免疫性疾病的概念。1964年，開始招收全國內(nèi)分泌專業(yè)進修醫(yī)師，來自廣西的于志清成為該學科的第一位進修生，但因“文革”來臨，被迫中斷。1973年，伍漢文與湖南醫(yī)學院遺傳學實驗室合作，對性染色體異常疾病進行研究，確診了國內(nèi)首例Turner綜合征。1978年，被批準為內(nèi)科學內(nèi)分泌專業(yè)碩士學位授權(quán)點。建立了鈣磷代謝平衡實驗室，重點研究糖尿病性骨質(zhì)疏松及其并發(fā)癥的發(fā)病機理、診斷和治療。1979年，招收第一位碩士研究生。
　　1980年，開展胰島素釋放試驗對糖尿病進行分型研究。1982年，經(jīng)衛(wèi)生部批準，恢復招收全國內(nèi)分泌專業(yè)進修醫(yī)師。1985年，成立內(nèi)分泌研究室。并在內(nèi)科教研室中設(shè)立內(nèi)分泌?？?。伍漢文教授發(fā)現(xiàn)寧鄉(xiāng)縣灰湯鄉(xiāng)地方性氟中毒骨病流行，成立研究組赴現(xiàn)場進行調(diào)查研究、診治和宣傳，使疾病終獲控制。1986年，被批準為內(nèi)科學內(nèi)分泌專業(yè)博士授權(quán)點。1987年，招收第一位博士研究生。1992年，列入衛(wèi)生部臨床重點建設(shè)學科。1993年，成立湖南醫(yī)科大學代謝內(nèi)分泌研究所。1994年得到香港同胞毛梁振華女士捐贈的兩臺貴重儀器：快速液相蛋白層析系統(tǒng)（FPLC）和液體閃爍計數(shù)儀，總價值約80萬元。同年底，內(nèi)分泌專科從內(nèi)科教研室分出，遷至三病室，設(shè)46張病床。1996年，代謝內(nèi)分泌學科通過國家“211”工程部門預審。共青團中央、衛(wèi)生部授予代謝內(nèi)分泌研究所“青年文明號集體”。
　　2000年，被批準為臨床醫(yī)學（內(nèi)科學）博士后流動站。2001年，被評為國家重點學科。2002年，廖二元教授當選國務(wù)院學位委員會學科評議組成員。2004年，成立中南大學糖尿病中心。2006年，成立中南大學代謝綜合征研究中心。在學校和醫(yī)院的大力支持下，新增兩百余平方米實驗室。內(nèi)分泌科病房搬遷至老外科樓四樓，設(shè)兩個病區(qū)，65張病床。2008年，周智廣教授牽頭的代謝綜合征研究團隊被評為湖南省高校創(chuàng)新團隊，并受湖南省衛(wèi)生廳委托組建湖南省糖尿病研究中心。2009年，糖尿病免疫學教育部重點實驗室批準立項建設(shè)。2010年，海外高層次人才劉峰教授入選國家“千人計劃”，加盟該學科。